一般的なシステムヘッダファイルへのリンクをデフォルトで設定しておくなど

[daisuke]

たとえばSmarty等は、/usr/local/lib/smartyなどをインポートヘッダファイルに
設定しておくことで、関数の色付け等はできる可能性高い。
（PHP等の文法認識精度向上も必要そうだが）
オープンソースならヘッダファイル同梱して、そのパスを設定しておく案もあるかもしれない。